В июне 2004 г. был проведен конкурс «Логотип Фонда Гейдара Алиева». На конкурс было представлено около 2500 логотипов. Объединив отдельные элементы 2-х выбранных логотипов, был принят логотип Фонда Гейдара Алиева. Алиев Фаиг Беджан оглу и компания «Дедлайн» были объявлены победителями конкурса.
Логотип Фонда Гейдара Алиева состоит из восьмиконечной звезды, образованной внутри другой восьмиконечной звезды из инициалов Гейдара Алиева «Н.Ə.». Восьмиконечная звезда, окружающая инициалы, означает объединение азербайджанского народа вокруг идей Гейдара Алиева.
В логотипе используются два цвета: голубой и золотистый. Голубой цвет символизирует небо, демократию, честность, чистоту, безвинность, покой, верность, надежность, искренность, уверенность. Золотистый цвет является символом солнца, мира, прогресса, светлого будущего.
Оба цвета отражают желания и идеи общенационального лидера Гейдара Алиева.